肉豆蔻不是肉桂，两者是不同植物的产物。肉豆蔻来源于肉豆蔻科植物的种子，而肉桂取自樟科植物的干燥树皮，在来源、外观、用途及成分上均有明显差异。
肉豆蔻是肉豆蔻科肉豆蔻属植物的成熟种仁，呈卵圆形或椭圆形，表面灰棕色至暗棕色，具有网状沟纹，气味芳香浓烈。其成分以挥发油为主，包括肉豆蔻醚、黄樟醚等，中医认为其具有温中行气、涩肠止泻的功效，常用于脾胃虚寒导致的腹痛、腹泻等症。而肉桂来源于樟科樟属植物的树皮，呈卷筒状或板片状，外表面灰棕色至黑棕色，内表面红棕色，有细纵纹，气味香甜。肉桂主要含肉桂醛、肉桂酸等成分，中医认为其可补火助阳、散寒止痛，适用于阳虚畏寒、腰膝冷痛等。
日常使用时需注意，肉豆蔻因含肉豆蔻醚等毒性成分，需严格控制剂量，过量可能引起眩晕、谵妄等中毒反应。肉桂性质辛热，阴虚火旺者不宜服用。两者虽均为温里药，但不可互相替代使用。建议在中医师指导下根据具体证候选择适宜药材。