红曲红作为天然食用色素，在合规使用下一般不具有毒性。其安全性主要与原料质量、加工工艺及摄入量等因素相关，但需注意避免过量或使用劣质产品。
红曲红主要通过红曲霉发酵产生，正规生产的红曲红需符合国家食品添加剂标准。该标准严格限制了可能存在的桔霉素含量，合格产品中这类物质的浓度通常低于安全阈值，不会对人体造成危害。但在未规范生产的情况下，发酵过程可能产生超标的桔霉素，长期过量摄入可能增加肝肾负担。部分人群对红曲霉代谢产物可能存在过敏反应，表现为皮肤瘙痒或消化道不适等症状。
日常选购红曲红相关食品或添加剂时，应通过正规渠道购买具备食品安全认证的产品。使用含红曲红的保健类产品时，需遵循推荐剂量并在医生指导下进行，避免与降脂药物同时服用。若食用后出现头晕、恶心等异常症状，建议暂停使用并及时就医排查原因。