黑芝麻的脂肪含量相对较高。根据食物成分分析，每100克黑芝麻约含有46-55克脂肪，属于高脂肪含量的食物类型。其脂肪主要由不饱和脂肪酸构成，包括亚油酸、油酸等有益成分，适量摄入对健康有一定益处。
黑芝麻中的脂肪含量显著高于许多常见谷物和坚果类食物。以100克可食部分计算，黑芝麻的脂肪含量约是核桃的1.3倍、杏仁的1.5倍。这些脂肪中单不饱和脂肪酸占比约40%，多不饱和脂肪酸约占10%，其余为少量饱和脂肪酸。其中亚油酸作为必需脂肪酸，具有调节血脂、维护细胞膜功能等作用，但需注意整体摄入量。
日常食用黑芝麻建议控制在每日10-15克以内，可通过撒在粥品、拌入酸奶等方式分散摄入。对于需要控制热量摄入的减重人群，或存在高脂血症等代谢性疾病者，更应注意食用量的把控。储存时应密封避光以防脂肪酸氧化，保持其营养价值。