基围虾头一般不建议食用。虾头含有消化器官和排泄残留物，可能存在重金属蓄积或细菌污染风险，过量食用可能引发健康隐患。虾头中的内脏组织较难被人体消化吸收，特殊人群更需谨慎。
基围虾头是虾类代谢活动的主要部位，容易积聚水体中的重金属元素如汞、铅等。长期或大量食用含重金属超标的虾头，可能造成重金属在人体内蓄积，影响神经系统和肝肾功能。虾在养殖过程中若接触污染水源，虾头部位的重金属含量可能比虾肉高数倍。
虾头中的鳃部和消化腺容易滋生细菌或寄生虫。若烹饪时未彻底加热，可能引发急性胃肠炎，出现腹痛、腹泻、呕吐等症状。沿海地区曾报告因食用未熟虾头导致副溶血性弧菌感染的病例。虾头中的胆固醇含量较高，每100克虾头胆固醇含量可达250毫克以上，是虾肉的2-3倍，高血脂人群需特别注意。
食用虾头后若出现皮肤瘙痒、喉头水肿等过敏反应，应立即停止食用并就医。日常处理基围虾时建议去除头部，烹饪时确保中心温度达到70℃并持续2分钟以上。对甲壳类过敏者、孕妇及婴幼儿应避免食用虾头，普通人群也应控制食用量。