益生菌片一般不建议含在嘴里服用，具体服用方式需参考药品说明书或遵医嘱。常见的益生菌片通常设计为吞服，以达到肠道内定植和调节菌群的作用。
益生菌片的主要成分为活性微生物，吞服时能减少口腔环境对菌群活性的影响。部分益生菌片的外层包被技术可帮助其顺利通过胃酸环境，提高到达肠道的存活率。若含服可能导致菌群提前释放，被唾液酶或口腔细菌破坏，降低药效。个别特殊剂型的益生菌含片会在说明书中明确标注口腔含服的使用方法，这类产品通常用于维护口腔菌群平衡。
服用益生菌片时需注意水温不宜超过40℃，避免与抗生素同时服用。若药品说明书未明确标注可含服，建议整片用温水送服。对于特殊人群如婴幼儿，可将片剂碾碎后溶于温凉液体服用，但需提前咨询医师确认该剂型是否适合拆分服用。