生殖器上长小脓包可能与毛囊炎、生殖器疱疹、梅毒等原因有关。具体原因需结合临床表现及检查结果综合判断，建议及时就医明确诊断。
1、毛囊炎
主要由细菌感染毛囊引起，如金黄色葡萄球菌感染，表现为局部红肿、疼痛的脓疱。患者需注意局部清洁，避免挤压，可遵医嘱使用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等外用药治疗。若伴随发热或脓液较多，可口服头孢克肟片、阿莫西林胶囊等抗生素。
2、生殖器疱疹
由单纯疱疹病毒感染导致，属于性传播疾病。典型症状为簇集性水疱，破溃后形成糜烂面，可能伴有灼痛或瘙痒。确诊后需遵医嘱使用阿昔洛韦乳膏、泛昔洛韦片等抗病毒药物，同时避免性接触防止传染。
3、梅毒
梅毒硬下疳二期可能出现脓疱样皮损，具有较强传染性。需通过血清学检测确诊，确诊后需规范注射苄星青霉素治疗，治疗期间需定期复查血清滴度，性伴侣应同步检查治疗。
日常需保持外阴清洁干燥，避免抓挠皮损部位。若出现溃烂渗液、腹股沟淋巴结肿大或发热等症状，提示感染可能加重，应立即到皮肤性病科就诊。所有药物均需在医生指导下使用，切勿自行购买药物治疗以免延误病情。