朱砂一般不能直接食用。其含有硫化汞成分，具有一定的毒性风险，若擅自服用可能引起中毒反应，需严格遵循中医指导使用。
朱砂在传统中医中主要作为矿物类药材使用，需经过炮制加工去除杂质，并通过配伍降低毒性。临床上通常将其研磨成极细粉末，与蜂蜜、糯米粉等辅料混合后制成丸剂或散剂，且用量需精确控制在0.1-0.5克范围内。现代药理研究表明，硫化汞在高温条件下可能分解产生游离汞离子，过量摄入会导致神经系统损伤和肝肾代谢负担。
在特殊病症治疗中，执业中医师可能将其用于惊悸失眠、癫痫惊风等症，但必须配合珍珠母、黄连等药材进行组方减毒。需特别注意孕妇、肝肾功能不全者禁止使用，儿童用药需严格把控剂量。若误服朱砂制品后出现口腔金属味、恶心呕吐等症状，应立即就医进行重金属检测和排毒治疗。
日常应避免将朱砂制品作为保健品或装饰品含服，存放时需置于儿童无法接触处。中药材的使用必须经过专业医师辨证论治，不建议自行购买或使用含朱砂成分的药品。