肉豆蔻作为一味中药材，通常具有温中行气、涩肠止泻、健胃消食、缓解疼痛以及抗菌等功效与作用。其药性辛温，归脾胃经，需在中医辨证指导下使用。
1、温中行气
肉豆蔻性温能散寒，辛香可走窜，能改善脾胃虚寒导致的气滞症状。其挥发油成分可促进胃肠蠕动，缓解因寒邪侵袭引起的脘腹胀满、食欲不振等问题，适用于脾胃虚寒型消化不良。
2、涩肠止泻
该药材含有大量鞣质和没食子酸等收敛成分，能减少肠道过度蠕动，增强肠道黏膜屏障功能。临床上常用于治疗脾肾阳虚引起的五更泄泻、久泻久痢，常与补骨脂、吴茱萸等配伍使用。
3、健胃消食
肉豆蔻所含的挥发油及苯丙素类化合物可刺激消化液分泌，增强胰脂肪酶活性。对于食积不化、嗳腐吞酸等症，能通过促进脂类物质分解改善消化功能，常与山楂、神曲同用。
4、缓解疼痛
其镇痉作用主要源于挥发油中的肉豆蔻醚，可通过调节平滑肌收缩缓解胃肠痉挛性疼痛。对于寒凝气滞导致的胃脘冷痛、肠鸣腹痛，能发挥温通止痛效果。
5、抗菌
现代药理研究表明，肉豆蔻提取物对金黄色葡萄球菌、痢疾杆菌等致病菌有抑制作用。其活性成分通过破坏细菌细胞膜结构抑制病原体繁殖，在感染性腹泻治疗中具有辅助价值。
使用肉豆蔻需注意炮制方法，煨制后可增强止泻功效。阴虚火旺及湿热泻痢者忌用，长期大量服用可能引起幻觉等不良反应。建议在中医师指导下根据具体证型配伍使用，避免自行用药。