蜈蚣具有一定的毒性。其毒液储存在头部的毒腺中，咬人时会通过颚足释放毒素，可能引起局部或全身反应。但大多数蜈蚣的毒性对人体并不致命，仅会造成短暂不适。
蜈蚣的毒性强弱与其种类和体型相关。例如体型较小的蚰蜒毒性较弱，咬伤后通常表现为皮肤红肿、疼痛或瘙痒；而大型蜈蚣如红头蜈蚣的毒液可能引发心悸、局部淋巴肿痛等较强反应。毒液成分主要包含组胺、5-羟色胺等炎性介质，以及少量神经毒素和溶血毒素。过敏体质者可能出现荨麻疹、呼吸困难等超敏反应，需要特别警惕。
被蜈蚣咬伤后应立即用肥皂水冲洗伤口，冰敷缓解肿胀，避免抓挠。若出现头晕、恶心、伤口溃烂或全身皮疹等症状，需及时就医。日常应注意保持环境干燥，减少蜈蚣藏匿机会。接触野外岩石、朽木时建议佩戴手套，夜间活动可使用照明工具防范蜈蚣靠近。