茯苓和茯神均为多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核，但两者在药用部位及功效上存在一定差异。茯苓通常指菌核的白色部分，而茯神特指菌核中带有松根的部分，两者在利水渗湿、健脾、安神等方面各有侧重。
1、药用部位不同
茯苓是菌核去皮后切制的白色部分，主要成分为菌核的菌丝体。茯神则选用菌核内部包裹松树根的部分，切片后可见淡棕色松根贯穿其中，因此又称“抱木茯神”。
2、功效侧重不同
茯苓主要具有利水渗湿、健脾宁心的作用，适用于水肿尿少、痰饮眩悸、脾虚食少等症状。茯神因含松木而增强安神效果，尤其擅长宁心安神，多用于心神不宁、惊悸失眠等症，如安神定志丸中便以茯神为主药。
3、应用范围差异
茯苓广泛应用于多种水湿停滞或脾虚证候，常与白术、泽泻等配伍，如五苓散。茯神则多见于安神类方剂，常与酸枣仁、远志同用，如归脾汤中同时使用茯苓健脾、茯神安神以增强疗效。
使用时应根据症状选择，失眠多梦者宜选茯神，脾虚水肿者宜用茯苓。具体用药需经中医师辨证指导，避免自行搭配，孕妇及阴虚火旺者需谨慎使用。