肉桂与桂枝虽同源但药用部位不同，疗效也存在一定差异。两者在性味归经、功效作用以及临床应用等方面各具特点，需在中医辨证指导下使用。
1、性味归经不同
肉桂为樟科植物肉桂的干燥树皮，其性味辛、甘、大热，归肾、脾、心、肝经，擅长温暖下焦。桂枝则为肉桂的嫩枝，性味辛、甘、温，归心、肺、膀胱经，具有升发向上的特性。两者归经差异决定了作用部位的偏向性，肉桂更侧重温补肾脾，桂枝偏重宣发上焦。
2、功效作用差异
肉桂以补火助阳见长，能引火归元，常用于治疗肾阳不足引起的腰膝冷痛、宫寒不孕等症。桂枝则长于发汗解肌、温通经脉，对风寒表证、胸痹心痛等气血运行不畅的病症效果显著。现代药理研究表明，桂枝中的桂皮醛成分具有更强的扩张血管作用。
3、临床应用区别
肉桂多用于虚寒证，常配伍附子、干姜治疗脾肾阳虚；桂枝多用于表证和气血瘀滞证，常与白芍、生姜配伍治疗风寒感冒。需注意的是，阴虚火旺者均需慎用，但桂枝因温燥之性较弱，在妇科调经方剂中使用更广泛。
两者均属温热药材，使用前需经中医师辨证。日常服用时需注意体质辨识，避免与赤石脂等中药发生配伍禁忌，煎煮时肉桂需后下以保留挥发油成分。