棉花子作为中药材，通常具有温肾助阳、止血、活血通经、补虚以及祛风湿等功效与作用。其药用价值需在中医理论指导下合理应用。
1、温肾助阳
棉花子性温，归肾经，能温补肾阳，改善肾阳不足引起的腰膝酸软、畏寒肢冷等症状。中医认为其通过激发肾气，促进体内阳气升发，从而缓解相关虚寒证候。
2、止血
其含有的鞣质等成分具有收敛作用，可作用于出血部位形成保护膜，适用于崩漏、便血等出血症状。临床多用于妇科异常子宫出血的辅助治疗。
3、活血通经
通过促进血液循环，改善气血运行不畅导致的痛经、闭经等问题。中医理论认为其能疏通经络瘀滞，恢复经血正常排出。
4、补虚
含蛋白质、脂肪等营养成分，可为体虚者提供能量支持，辅助改善气血两虚引起的乏力、面色苍白等状态。常与其他补益药材配伍使用。
5、祛风湿
药性辛温能散寒除湿，对风寒湿邪侵袭引起的关节疼痛、活动受限有缓解作用。外敷或配伍祛风湿方剂可增强疗效。
需特别注意的是，棉花子含有棉酚等毒性成分，过量使用可能导致中毒反应。建议在中医师辨证指导下规范使用，严格掌握炮制方法和剂量。孕妇、肝功能异常者慎用，出现恶心、头晕等不适需立即停用并就医。日常储存应置于阴凉干燥处，避免有效成分分解。