抗过敏益生菌可能对部分人群的过敏症状有一定调节作用，但其效果因人而异，不能替代常规治疗。目前研究认为其作用机制可能与调节肠道菌群、增强免疫调节功能有关，但具体效果需结合个体情况判断。
1、调节免疫平衡
部分益生菌可通过刺激肠道淋巴组织，促进Th1型免疫反应，从而抑制Th2型过敏反应过度活跃。动物实验显示鼠李糖乳杆菌等菌株能降低血清IgE水平，但人体试验结果存在差异。
2、改善肠道屏障
益生菌可增加肠道紧密连接蛋白表达，减少过敏原通过肠黏膜进入血液的概率。临床观察发现双歧杆菌能缓解部分婴幼儿特应性皮炎，但起效时间通常需要4-8周。
3、菌株特异性差异
不同菌株作用差异显著，目前仅有鼠李糖乳杆菌GG株等少数菌株有较充分研究数据。2015年世界过敏组织指南指出，特定益生菌对湿疹预防证据等级为B级，但对其他过敏性疾病证据不足。
使用抗过敏益生菌前建议咨询变态反应科医生，中重度过敏患者仍需以抗组胺药、糖皮质激素等规范治疗为主。日常需注意避免接触过敏原，保持环境清洁，严重过敏反应时应立即就医。