鱼腥草在常规食用情况下通常没有毒性，但需注意潜在风险。其安全性主要与食用方式及个体差异有关，合理使用下一般不会引起中毒反应。
鱼腥草含有少量马兜铃内酰胺类物质，这类成分在动物实验中显示可能具有肾毒性。但人类日常食用剂量远低于实验用量，且经过高温烹饪后部分成分会被分解，因此凉拌或煮汤等常规食用方式相对安全。传统中医将干燥鱼腥草作为药材使用时，通常需要经过炮制处理，进一步降低潜在风险。
特殊体质人群需谨慎接触鱼腥草。部分人接触新鲜植株汁液可能出现皮肤瘙痒等接触性皮炎症状，这与植物含有的挥发性成分有关。过敏体质者首次食用建议少量尝试，观察是否出现皮疹、呼吸困难等过敏反应。孕妇群体虽无明确食用禁忌，但作为中药材使用时应严格遵医嘱。
建议日常食用新鲜鱼腥草前用沸水焯烫，既能去除部分生物碱又能减轻腥味。若作为药用，应选择正规渠道的炮制品，避免长期大剂量使用。出现任何不适症状应及时停止食用并就医检查，由专业医生评估具体情况。