蛏子的黑色部分一般不建议食用。这部分通常为蛏子的内脏团，可能含有泥沙、代谢废物或重金属等物质，直接食用可能存在健康风险。
蛏子的内脏团位于壳体闭合处的黑色区域，是消化系统和排泄物的集中部位。由于蛏子属于滤食性生物，在生长过程中可能摄入海水中的藻类毒素、重金属离子等有害物质，这些物质容易在内脏中蓄积。尤其是野生蛏子，受环境污染的影响更为明显。若长期或大量食用未经处理的内脏，可能增加重金属中毒或微生物感染的风险。烹饪时建议用刀尖沿着蛏子外壳内壁轻轻刮除黑色部分，保留白色闭壳肌和裙边等可食部位。
处理蛏子时应先浸泡在淡盐水中吐沙2-3小时，用流动水冲洗外壳。烹饪时需彻底加热至肉质完全变白，避免生食或半生食用。对于消化功能较弱的人群，更需注意完全去除内脏。若食用后出现腹痛、腹泻等症状，应及时就医检查。