土茯苓和茯苓在药性上存在一定差异，需根据具体病症进行选择。土茯苓性平味甘淡，归肝、胃经，具有清热解毒、除湿通络等功效；茯苓性平味甘淡，归心、肺、脾、肾经，主要功效为利水渗湿、健脾宁心。
1、性味归经
土茯苓归肝经和胃经，能针对湿热毒邪引发的皮肤疮疡、关节肿痛发挥疗效。茯苓归心、肺、脾、肾经，其利水作用可覆盖全身多个脏腑系统，尤其擅长调理脾虚湿盛引起的水肿、便溏等症状。
2、功效差异
土茯苓侧重解毒除湿，临床多用于梅毒、湿热淋浊、痈肿瘰疬等症，现代研究显示其有效成分对螺旋体感染有抑制作用。茯苓以健脾利水见长，既能通过增加尿液排出改善水肿，又能通过增强脾胃运化功能缓解食少腹胀，其宁心安神作用对心悸失眠也有调节效果。
3、使用禁忌
土茯苓不适合肝肾阴虚者长期使用，可能加重阴液耗损。茯苓对于阴虚而无湿热、虚寒滑精者需慎用，避免损伤正气。两者均需避免与茶同服，可能影响药效吸收。
出现皮肤溃烂、关节红肿等湿热毒盛症状时可考虑土茯苓，而脾虚湿滞、心神不宁者宜选茯苓。具体用药需经中医师辨证，根据体质特点和病情发展阶段合理配伍，不可自行盲目选用。