新生儿便秘可能是新生儿胎粪便秘，也有可能与新生儿体内上火有关，也有可能是饮水量不足造成的。
通常情况下，新生儿在出生后48小时内没有排便，可能会导致胎粪堵住肛门，可使用开塞露润滑肛门帮助粪便顺利排出。如果是母乳喂养，母亲饮食不健康，使用生冷辛辣刺激的食物，会通过乳汁传递给新生儿，引起新生儿体内上火，母亲可通过调养饮食结构，以清淡软烂易消化为主，适当添加维生素蛋白质矿物质含量较多的水果和蔬菜，帮助新生儿恢复健康。
另外可给予新生儿喂水，可能会达到清洁肠道、软化大便的作用。