两个月宝宝肚子咕咕叫的原因大多数是腹部受凉、肠胃功能紊乱、肠道感染等，原因有太多种，需要到医院检查后才能确定。
1、腹部受凉：两个月宝宝肚子咕咕叫，很可能是在生活当中没有做好腹部保暖措施，导致受凉后所引起的症状，可以使用热毛巾或热水袋在腹部热敷。
2、肠胃功能紊乱：宝宝两个月的时候肠胃功能还没有完全生长发育正常，有部分在饮食不规律的情况下会引起肠胃功能紊乱，也会导致肚子咕咕叫，可以在腹部沿着顺时针方向按摩，对恢复会有帮助。
3、肠道感染：两个月的宝宝肚子咕咕叫，要让专业医生诊断是否出现了肠道感染，如果是肠道内炎症感染引起的，需要遵医嘱服用肠炎宁颗粒和头孢克肟颗粒等药物治疗。
除了以上这些因素之外，也不排除是肠胀气。