宝宝生理性腹泻多数是乳糖酶活性偏低或是存在有乳糖酶先天性缺乏，一般可以通过使用益生菌药物调理。
宝宝偏小情况下一般消化功能并没有发育完善，可能会存在身体乳糖酶活性偏低情况，有可能是身体存在先天性乳糖酶缺乏，容易出现消化功能较差和母乳喂养期间容易出现生理性腹泻，可能会出现一天中大便好几次，并不会出现哭闹或是精神异常等多种不良反应，随着宝宝发育多数在6个月以后症状会得到改善，属于生理性腹泻。
腹泻程度较严重时还可以在医生指导下使用复方鸡内金散、双歧杆菌活菌散等益生菌药物调理。