月经干净后第三天是否会排卵，需要根据个人情况进行判断，不能一概而论。
1、一般不会排卵的情况：如果女性的月经周期比较规律，月经周期为21天-35天，此时排卵是固定的，一般在下次来月经之前的14天左右会排卵，所以此时不会排卵。
2、一般会排卵的情况：若女性的月经周期不规律，此时排卵期也可能不固定，所以可能会排卵。如果夫妻双方有生育的需求，可以在此时同房，能够增加受孕概率。若夫妻双方没有生育的打算，需要做好避孕措施。