阴茎根部起疱疹可能是饮食不当、过敏、毛囊炎等原因引起的，建议患者在医生的指导下进行治疗。
1、饮食不当：吃辛辣刺激性的食物和过分油腻食物引起的疱疹，可在饮食中多吃一些清淡易消化的食物，和新鲜的蔬菜水果方可改善疱疹的症状。
2、过敏：异物过敏和食物过敏导致的疱疹，可在医生指导下使用氯雷他定和盐酸西替利嗪等药物进行治疗。
3、毛囊炎：患有毛囊炎的患者在阴茎根部有少许的疙瘩可遵医嘱使用，喷昔洛韦乳膏和阿昔洛韦乳膏等药物进行涂抹。
除此之外，阴茎根部起疱疹有可能是包皮龟头炎等病变引起的，可遵医嘱使用红霉素软膏，酮康唑乳膏等药物进行治疗。建议在医生的指导下进行治疗。