1、细菌或者病毒的感染。常以沙门菌属和嗜盐菌感染最常见,毒素以金黄色葡萄球菌常见,病毒亦可见到,如轮状病毒、诺沃克病毒、星状病毒等等。特别是诺沃克病毒,任何季节在成人和儿童中均可致病,而且可以通过水源污染传染,容易引起严重腹泻。常有集体发病或家庭多发的情况。如吃了被污染的家禽、家畜的肉;或吃了嗜盐菌生长的蟹等海产品及吃了被金黄色葡萄球菌污染了的剩菜等而诱发本病。
2、物理化学因素。进食生冷食物或某些药物如水杨酸盐类、磺胺、某些抗生素等;或误服强酸、强碱等均可引起本病。
3、急性胃肠炎并发疾病。脱水电解质不平衡、肠穿孔、败血症等一系列的症状全部都可能会导致急慢性胃肠炎的发病。
4、寄生虫:比较少见由肠道寄生虫引起胃肠炎。也不易传播。但该病症可引起慢性病或引起其他病变。各地均有发现由于生食螺肉(福寿螺、东风螺)而传染于人体的管圆线虫就可能引起胃肠炎并引起更严重的病变。