1、病史通常是模糊不清，为非特异性的，相对于心脏疾病而言更像全身性感染或发炎。临床症状依赖于所涉及的器官，可能反映了改变的瓣膜功能。脓血症和菌血症;血管栓塞疾病在关节、肾脏、肌肉、心肌、肺和中枢神经组织的局部感染;影响关节和肾小球的继发性免疫介导性疾病。
2、该病的末期可能出现心杂音。心杂音可能是心缩音或心舒音，强度随时问而改变。血管栓塞可引起心肌梗塞或心肌炎，并导致心律不齐。一些病例出现左心衰竭的症状。
3、除心肌症状外，还包括嗜眠，厌食，失重，间歇热，跛足(经常随品种而改变)，肌肉紧张，淤斑或淤血性出血，呼吸困难和癫痫发作。感染直接扩散到一个或多个关节可导致脓性多发性关节炎，或持久的抗原刺激引起免疫复合物沉积于关节膜，并出现非脓性(非坏死性)免疫介导的多发性关节炎。
细菌性心内膜炎的鉴别诊断：
1. 亚急性细菌性心内膜炎：常发生在原有心脏病(如心瓣膜病 先心病)基础上合并细菌感染所致。病原菌多系草绿色链球菌，少数为大肠杆菌。属中医“温病”范畴。
2. 急性细菌性心内膜炎：50-60%发生于正常心瓣膜，瓣膜及腱索可有溃疡穿孔，腱索断裂及大而脆的赘生物，赘生物脱落为细菌栓子，导致栓塞及迁移性脓肿。
预防：对亚急性细菌性心内膜炎的愈后应谨慎。杀菌性抗生素使用剂量应在最小抑菌浓度以上，至少使用4～6周(7天肠外给药，随后口服)。
抗生素的选择应尽量根据血液培养的结果。在等待结果期间或培养呈阴性的动物，则应联合用药，氨苄西林和庆大霉素合用，静脉给药至少5～7天(监控肾脏功能)。然后再连用阿莫西林和喹诺酮类药物如恩氟杀星。口服3～5周。
另外，对于心律不齐和充血性心衰也应给予合适的治疗。
