大便时肛门疼痛可能是便秘、痔疮或肛裂等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1.便秘：便秘是导致大便时肛门疼痛的常见原因之一。由于粪便干燥、硬结，排便时需要用力，容易损伤肛门，引起疼痛。治疗便秘可使用聚乙二醇和益生菌等药物，同时注意饮食调理，增加膳食纤维的摄入。
2.痔疮：痔疮是指肛门周围静脉曲张形成的疾病，可分为内痔和外痔。痔疮患者在排便时，由于粪便对痔疮的压迫和摩擦，会引起肛门疼痛。治疗痔疮可使用复方角菜酸酯栓、地奥司明片等药物，必要时可考虑手术治疗。
3.肛裂：肛裂是指肛门黏膜出现裂伤，常见于便秘患者。排便时，粪便通过狭窄的肛管，对裂口造成刺激和摩擦，引起剧烈疼痛。治疗肛裂可使用复方黄连素片、复方利多卡因乳膏等药物，同时注意保持大便通畅，避免用力排便。
除以上原因外，还可能与肛周脓肿、肛管炎等因素有关。日常生活中，应注意个人卫生，避免长时间坐立，定期进行肛肠检查。如疼痛持续不缓解，应及时就医，以免延误病情。