扁平疣通常不会自愈。这种由人乳头瘤病毒（HPV）引起的皮肤病变，往往需要通过医疗干预来治疗。尽管在某些情况下，免疫系统可能会清除病毒，但大多数情况下，扁平疣需要通过药物或物理疗法来治疗。
扁平疣的治疗方法多种多样，从轻微的外用药物到更为复杂的物理疗法。常见的外用药物包括水杨酸、三氯醋酸和咪喹莫特莫德。这些药物可以局部应用，以减少疣体的大小和数量。然而，它们可能需要数周甚至数月才能见效，并且可能会引起皮肤刺激或过敏反应。在某些情况下，医生可能会建议进行液氮冷冻治疗、激光治疗或电切术，这些方法可以更快速地去除疣体，但可能伴随一定的疼痛和恢复期。重要的是，无论选择哪种治疗方法，都应在医生的指导下进行，以确保安全和效果。
对于扁平疣的治疗，建议患者保持耐心，并遵循医生的建议。同时，保持良好的个人卫生习惯，避免与他人共用毛巾或衣物，可以减少病毒传播的风险。