扁平疣一般可以自愈。扁平疣是由人乳头瘤病毒（HPV）引起的皮肤赘生物，多数情况下，随着人体免疫力的增强，病毒被清除，疣体会逐渐消失。然而，自愈过程可能需要较长时间，且并非所有扁平疣都能自愈。
在治疗扁平疣时，医生可能会根据病情推荐不同的治疗方法。例如，外用药物如水杨酸软膏、三氯醋酸溶液等，可以用于局部治疗，促进疣体脱落。免疫调节剂如干扰素，也可以增强机体免疫力，帮助清除病毒。需要注意的是，这些药物的使用应在医生指导下进行，以确保安全和有效。
对于扁平疣患者，建议保持良好的生活习惯，增强自身免疫力，同时定期随访医生，根据病情变化调整治疗方案。