木瓜一般可以生吃，但需根据木瓜的成熟程度以及个人体质决定。生吃前需注意清洗干净，避免摄入果皮上残留的杂质或农药。
成熟木瓜的果肉柔软香甜，含有丰富的维生素C、胡萝卜素以及木瓜蛋白酶等营养成分，直接生吃有助于补充水分和膳食纤维。未完全成熟的青木瓜中木瓜蛋白酶含量较高，直接生吃可能刺激口腔和胃黏膜，导致口舌发麻或胃部不适。这类木瓜建议削皮后凉拌或炖煮食用，以降低刺激性。
部分人群对木瓜中的蛋白酶或果胶可能存在过敏或不耐受反应，食用后可能出现皮肤瘙痒、腹泻等症状。既往有过敏史或胃肠道敏感者需谨慎尝试生吃木瓜，必要时可去皮后少量食用，观察身体反应。
日常建议选择表皮金黄、按压略有弹性的成熟木瓜生吃。食用后若出现明显不适，应停止进食并及时就医。储存时避免潮湿环境，防止变质。