长期服用维生素B12通常安全性较高，但大剂量或长期过量使用可能引发副作用，具体与个人体质及服用剂量有关。正常剂量下，维生素B12可通过尿液代谢，一般不会蓄积中毒。
维生素B12的副作用常见于每日摄入量远超推荐值的情况下。例如，大剂量服用可能刺激胃肠道黏膜，导致恶心、腹泻或腹部不适。部分人群可能出现皮肤过敏反应，如皮疹、瘙痒等。此外，长期过量可能干扰神经系统功能，引发头晕、头痛或肢体麻木感。若存在钴过敏史，服用维生素B12还可能诱发过敏反应。
对于已确诊维生素B12缺乏的患者，需在医生指导下规范补充，避免擅自调整剂量。健康人群若无明确缺乏症状，通常无需长期额外补充。若因治疗需要长期用药，建议定期监测血清维生素B12水平及血液相关指标，及时调整治疗方案。