臭豆腐在正规生产且适量食用的情况下一般可以吃，但不当制作或过量食用可能存在一定的致癌风险。其安全性及健康影响与原料质量、制作工艺等因素有关。
正规发酵制作的臭豆腐经过特定菌种发酵，蛋白质被分解为氨基酸，更易消化吸收，且可能产生少量维生素B12。这类产品在符合食品安全标准的情况下，正常食用不会直接致癌。但部分小作坊生产的臭豆腐存在杂菌污染风险，发酵过程中可能产生黄曲霉毒素等致癌物质。此外，高温油炸的烹饪方式会使臭豆腐产生苯并芘等致癌物，长期大量摄入可能增加患癌风险。
日常食用建议选择正规厂家生产的臭豆腐，每周食用不超过2-3次，每次摄入量控制在100克以内。避免与腌制食品、烧烤类食物同食，可搭配新鲜蔬菜补充膳食纤维。消化功能较弱或患有慢性胃炎的人群应减少食用频率。若食用后出现持续腹痛、腹泻等不适，需暂停摄入并观察身体反应。