金针菇正常食用一般不会中毒，但需确保充分煮熟且未变质。若食用未煮熟或变质的金针菇可能引起胃肠道不适，但通常不属于真正意义上的中毒。
未煮熟的金针菇中含有一种名为“菇甲素”的蛋白质成分，可能刺激胃肠道黏膜，导致恶心、呕吐或腹泻等不适症状。充分加热后这种成分会被破坏，因此建议沸水煮5分钟以上。变质的金针菇可能滋生细菌或霉菌，食用后可能引发急性胃肠炎，出现腹痛、腹泻等症状，需与食物中毒区分。
日常食用时应选择新鲜、无霉斑的菌菇，烹饪前用流水冲洗干净。建议用充足水量进行炖煮，避免凉拌生食。若食用后出现持续腹痛、频繁呕吐或发热症状，应及时就医检查。