扁平疣存在自愈的可能性，但自愈时间因人而异，部分患者可能需要数月甚至数年。若皮损持续不消退或出现扩散，建议及时就医进行规范治疗，避免抓挠刺激患处。
扁平疣由人乳头瘤病毒感染引起，当人体免疫系统识别并清除病毒时，皮损可能逐渐消退。部分青少年患者随着免疫功能增强，可能在1-2年内自行消退。对于病程较长、皮损数量较多或免疫抑制状态的患者，通常难以自愈，需借助医疗干预。常见治疗方法包括维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等局部药物治疗，以及冷冻治疗、激光治疗等物理疗法。
日常应保持皮肤清洁干燥，避免与他人共用毛巾等物品。若皮损突然发红、瘙痒或短期内数量激增，提示可能出现同形反应，应及时到皮肤科就诊。治疗期间需遵医嘱定期复诊评估疗效，切勿自行使用腐蚀性药物或偏方处理。