蕨苔含有一定量的原蕨苷，这种物质被国际癌症研究机构列为2B类致癌物，可能对人体存在潜在致癌风险。但偶尔或少量食用通常不会直接导致癌症，长期大量摄入可能增加风险。
蕨苔中的原蕨苷在动物实验中显示可能引发消化道肿瘤，其作用机制可能与DNA损伤和细胞异常增生有关。人类流行病学研究显示，某些地区长期大量食用蕨苔的人群胃癌、食道癌发病率略高于普通人群，但具体致癌剂量尚无明确结论。新鲜蕨苔经高温焯煮或腌制处理后，原蕨苷含量可降低约80%，适当加工可减少风险。目前世界卫生组织建议每周摄入量不超过50g生蕨苔，过量食用可能使致癌物蓄积。
食用蕨苔时应先焯水3-5分钟，再用清水浸泡24小时，期间换水2-3次。建议每月食用不超过2次，每次控制在30g以内。日常饮食注意搭配富含维生素C的蔬果，如猕猴桃、彩椒等，帮助阻断亚硝酸盐转化。若食用后出现腹痛、黑便等异常症状，应及时到消化内科就诊。