酸枣仁通常被认为具有镇静和安神的作用，一般不具有明显的毒副作用。然而，任何含有活性成分的草药都有可能因为个体差异、剂量控制不当或与其他药物相互作用而产生不良反应。
酸枣仁含有的酸枣仁皂苷、酸枣仁多糖等成分，在正确使用时可以发挥其助眠和抗焦虑的效果。但若过量摄入，可能会引起一些轻微的副作用，如头晕、恶心或腹泻。例如，酸枣仁与某些抗凝血药物如华法林、阿司匹林等同时使用时，可能增加出血风险；与抗抑郁药物如氟西汀、帕罗西汀等合用时，可能影响药物效果或增加副作用。因此，使用酸枣仁前应咨询医生，确保用药安全。
在使用酸枣仁时，应注意遵循医生的指导，避免与其他可能产生相互作用的药物同时使用，以减少不良反应的发生。