感冒发烧39℃时，一般可以采取以下方法进行处理：生活调理、物理治疗、药物治疗。
1. 生活调理首先应保证充足的休息，避免过度劳累，同时保持室内空气流通，避免接触病毒和细菌。饮食上应以清淡为主，多饮水，以助于降低体温和排出体内毒素。
2. 物理降温可以使用温水擦洗身体，特别是额头、腋下和腹股沟等部位，以帮助散热。此外，也可以使用冰袋敷在额头上，但要注意不要直接接触皮肤，以免造成冻伤。
3. 药物治疗在医生指导下，可以服用对乙酰氨基酚、布洛芬或者阿司匹林等退烧药，以缓解发烧症状。这些药物可以帮助降低体温，减轻不适感，但需注意不要超过推荐剂量，并遵医嘱用药。
在感冒发烧39℃时，除了上述方法外，还应注意观察症状变化，如持续高烧不退或伴有其他严重症状，应及时就医。