生殖器长了小疙瘩可能是由于皮肤感染、生殖器疱疹或者尖锐湿疣等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善，常见的治疗方式有生活调理、药物治疗等。
1.皮肤感染
局部皮肤受到细菌或真菌侵害，可能会形成小疙瘩。常见的治疗方法包括使用抗生素软膏如红霉素软膏、氯霉素软膏等，以及抗真菌药物如复方酮康唑软膏、克霉唑软膏等，应在医生指导下使用。
2.生殖器疱疹
由单纯疱疹病毒引起的性传播疾病，表现为生殖器部位出现小水疱或疙瘩。治疗上可以使用抗病毒药物如阿昔洛韦、泛昔洛韦和伐昔洛韦等，需要遵医嘱用药。
3.尖锐湿疣
由人乳头瘤病毒引起的性传播疾病，表现为生殖器部位出现菜花状小疙瘩。治疗方法包括物理治疗如冷冻、激光等，以及外用药物如鬼臼毒素软膏、咪喹莫特乳膏等，应在医生指导下进行。
除以上原因外，还可能与过敏反应、皮肤病等因素有关。日常生活中应注意生殖器部位的清洁卫生，避免不安全性行为，如有异常应及时就医。