苦杏仁通常含有一定毒性，但适量食用一般不会引起中毒。其毒性主要来源于苦杏仁苷，不当处理或过量食用可能引发不适。
苦杏仁中含有苦杏仁苷，该物质在口腔和消化道中可被分解产生氢氰酸。氢氰酸会抑制细胞呼吸酶活性，导致细胞缺氧，成年人摄入50-60粒未经处理的苦杏仁可能引发中毒。中毒症状包括恶心、头晕、心悸等，严重时会出现呼吸困难甚至昏迷。
日常食用需严格控制摄入量，建议成年人每日不超过10粒。食用前应通过沸水煮沸或高温烘烤处理，使杏仁中的水解酶失活，减少有毒物质释放。市售的加工杏仁制品通常已经过脱毒处理，安全性较高。
若误食过量生苦杏仁，应立即停止摄入并饮用温开水催吐。出现口唇麻木、恶心等中毒症状时需及时到急诊科就医，通过亚硝酸钠、硫代硫酸钠等药物进行解毒治疗。储存时应放置在儿童无法触及的位置，避免误食风险。