茯苓与茯神的主要区别在于药用部位及功效侧重。茯苓是多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核，而茯神特指茯苓菌核中带有松根的部分，两者在来源、功效及临床应用上存在差异。
1、来源区别
茯苓取自菌核的白色部分，经切块或切片制成；茯神则需保留菌核内部的松根，形成“茯神木”结构，因此茯神的形成与松树根密切相关。
2、功效区别
茯苓以利水渗湿、健脾宁心为主，适用于水肿尿少、脾虚食少等症状；茯神因含有松根，中医认为其安神定志效果更显著，多用于心悸失眠、心神不安等症。
3、归经区别
两者均归心、脾经，但茯神因松根入药，归经侧重心、肝二经，在调节情志方面更具针对性。
4、配伍区别
茯苓常与白术、桂枝配伍用于健脾祛湿；茯神多与酸枣仁、远志同用以增强安神效果，如经典安神方剂酸枣仁汤便选用茯神。
5、成分差异
现代研究显示茯神中松脂酸等萜类物质含量高于茯苓，这些成分可能与中枢神经系统调节作用相关。
选择时应根据具体症状：水肿、脾虚选茯苓，失眠焦虑宜用茯神。二者均需经专业医师辨证使用，避免自行混用影响疗效，阴虚火旺者慎用茯神。