酵素一般建议在早晨空腹、餐前半小时、餐后一小时或睡前两小时饮用，具体时间需根据个人需求调整。饮用时间的选择与酵素类型及个体消化吸收特点有关，合理的时间安排有助于提升其效果。
1、早晨空腹晨起空腹时胃酸分泌较少，此时饮用酵素可能更易被吸收利用。部分人群认为此时饮用可促进肠道蠕动，帮助清理宿便。但胃肠敏感者空腹饮用可能出现胃部不适，需谨慎选择。
2、餐前半小时餐前饮用酵素可为消化系统提供辅助酶类，有助于食物中蛋白质、脂肪等成分的分解，这种饮用方式适合消化功能较弱或需改善营养吸收的人群，但应避免与过烫的饮品同时服用。
3、餐后一小时餐后饮用酵素可辅助食物消化，减轻胃肠负担。此时胃内食物与消化液混合较为充分，酵素活性可能得到更好发挥。对于容易出现餐后腹胀、嗳气等消化不良症状者较为适宜。
4、睡前两小时夜间新陈代谢速率减缓时饮用，可能辅助机体进行代谢调节。部分含有特定成分的酵素产品建议睡前服用，但需注意避免饮用后立即平卧，防止引发胃食管反流。
选择酵素饮用时间时，建议根据产品说明及自身胃肠适应度进行调整。初次服用者可从餐后时段开始尝试，逐步观察身体反应。若出现胃痛、反酸等不适症状，应及时调整饮用时间或暂停使用。特殊体质及慢性疾病患者使用前应咨询专业医师或营养师建议。