坐飞机时耳朵疼可能是气压变化、耳部疾病或耳咽管功能障碍等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1.气压变化：飞机起飞和降落时，气压会迅速变化，导致耳膜内外压力不平衡，从而引起耳痛。这种情况可以通过咀嚼口香糖、做吞咽动作或使用耳塞来缓解。
2.耳部疾病：中耳炎、外耳道炎等耳部疾病也可能导致坐飞机时耳朵疼痛。治疗这类疾病通常需要使用抗生素，如阿莫西林、头孢克肟和左氧氟沙星等，应在医生指导下用药。
3.耳咽管功能障碍：耳咽管是连接中耳和咽部的通道，功能障碍可能导致耳压调节不畅，引起耳痛。这种情况可能需要通过药物治疗，如使用鼻用喷雾剂如布地奈德鼻喷雾剂、口服药物如孟鲁司特钠片等，同时配合物理治疗。
除以上原因外，还可能与个人体质、过敏反应等因素有关。建议在飞行前做好耳部保健，如有必要，可在医生指导下使用相关药物，并在出现不适时及时就医。