陈皮发霉后一般建议丢弃处理，避免食用，同时需检查储存环境并采取相应措施防止再次霉变。日常应选择干燥、密封的方式储存陈皮，以延长其保存时间。
陈皮发霉后其内部可能已滋生霉菌，即使去除表面霉斑，仍可能存在黄曲霉毒素等有害物质，食用后可能引发腹痛、腹泻等不适症状。因此，发现陈皮发霉时应当直接丢弃，不可继续食用或晾晒后二次使用。若与其他物品共同存放，需检查相邻物品是否被污染，必要时一并处理。
储存环境潮湿、温度过高或密封不严是导致陈皮发霉的主要原因。日常应将陈皮存放在阴凉干燥处，使用密封罐或保鲜袋隔绝空气和湿气。定期检查储存容器的密封性，若发现受潮迹象可放置在阳光下短时间晾晒，但需避免暴晒导致有效成分流失。
若误食发霉陈皮后出现恶心、呕吐等消化道症状，建议及时就医处理。未发霉的陈皮可研磨后用于泡水、煮粥或炖汤，但需注意控制摄入量，避免过量引起上火。储存时还可放入食品干燥剂辅助吸潮，降低霉变风险。