跑完步膝盖疼可能是由于肌肉疲劳、关节磨损或软组织损伤等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1. 肌肉疲劳长时间跑步可能导致腿部肌肉过度使用，造成肌肉疲劳和轻微拉伤。这种情况下，可以通过休息、冷敷和轻柔按摩来缓解疼痛。
2. 关节磨损跑步时膝关节承受较大压力，长期跑步可能导致关节软骨磨损，引发疼痛。治疗时可使用非甾体抗炎药如布洛芬、双氯芬酸钠等药物缓解炎症和疼痛，同时配合物理治疗和适当的关节保护措施。
3. 软组织损伤跑步时不慎扭伤或撞击可能导致膝关节周围软组织损伤，如韧带拉伤或肌腱炎。治疗时可使用外敷药膏如酮洛芬凝胶、双氯芬酸二乙胺凝胶软膏等药物减轻炎症，同时需要适当休息和避免剧烈运动。
除以上原因外，还可能与个人跑步姿势不正确、鞋子不合适等因素有关。日常跑步时应注意选择合适的跑鞋，保持正确的跑步姿势，并在感到不适时及时就医。