蕨菜含有原蕨苷等物质，国际癌症研究机构将其列为2B类致癌物，但通常适量食用不会明显增加致癌风险。日常通过高温烹饪可降低潜在危害，无需过度担忧。
蕨菜中的原蕨苷在动物实验中显示可能诱发消化道肿瘤，但这种物质易溶于水且不耐高温。通过焯水、蒸煮等烹饪方式能有效破坏其结构，降低含量。目前尚无充分证据证明人类食用加工后的蕨菜会直接致癌，但存在剂量累积的潜在可能。
建议控制食用频率和数量，每月不超过2-3次，每次摄入量在100克以内。对于有消化道疾病史或肿瘤家族史者，可适当减少食用。日常保持饮食多样性，避免长期单一食用某种可能存在风险的食物。