通常，煮过的木耳隔夜后仍然可以食用，但需要妥善保存。木耳在烹饪后，如果暴露在空气中，容易滋生细菌，因此应当将其放入密封容器中，存放在冰箱中以减缓细菌增长。同时，食用前应检查木耳是否有异味或变色，这是判断其是否变质的重要依据。
在保存过程中，木耳可能会吸收冰箱中的异味，因此建议使用保鲜膜或密封盒进行隔离。此外，一些常见的食品保存剂，如山梨酸钾、苯甲酸钠和丙酸钙，可以在一定程度上延长食品的保质期，但这些添加剂的使用应在食品加工过程中严格控制，并且木耳作为食材，通常不建议添加这些化学物质。在食用前，应彻底加热以杀死可能存在的细菌。
为了食品安全，建议不要食用任何有异味、变色或发霉的木耳。如果对木耳的新鲜度有疑问，最好丢弃，以免引起食物中毒。